MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015183	GCG	2	6	283130	283135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291726
6002	NC_015183	GGC	2	6	283163	283168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291726
6003	NC_015183	TCA	2	6	283224	283229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291726
6004	NC_015183	CGG	2	6	283240	283245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291726
6005	NC_015183	TGC	2	6	283255	283260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291726
6006	NC_015183	GT	3	6	283302	283307	0 %	50 %	50 %	0 %	325291726
6007	NC_015183	GC	4	8	283395	283402	0 %	0 %	50 %	50 %	325291726
6008	NC_015183	TTTC	2	8	283420	283427	0 %	75 %	0 %	25 %	325291726
6009	NC_015183	CGT	2	6	283444	283449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291726
6010	NC_015183	CGC	2	6	283507	283512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291726
6011	NC_015183	TCGGC	2	10	283582	283591	0 %	20 %	40 %	40 %	325291726
6012	NC_015183	TCC	2	6	283608	283613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291726
6013	NC_015183	CCT	2	6	283729	283734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_015183	ACGA	2	8	283736	283743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_015183	GCT	2	6	283771	283776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_015183	AT	4	8	283826	283833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_015183	CGC	2	6	283845	283850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_015183	GAG	2	6	283900	283905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291727
6019	NC_015183	GGC	4	12	284040	284051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291727
6020	NC_015183	CGCC	2	8	284075	284082	0 %	0 %	25 %	75 %	325291727
6021	NC_015183	GCCA	2	8	284101	284108	25 %	0 %	25 %	50 %	325291727
6022	NC_015183	CG	3	6	284143	284148	0 %	0 %	50 %	50 %	325291727
6023	NC_015183	G	6	6	284170	284175	0 %	0 %	100 %	0 %	325291727
6024	NC_015183	CCA	2	6	284176	284181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291727
6025	NC_015183	GCC	2	6	284188	284193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291727
6026	NC_015183	TCT	2	6	284252	284257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291727
6027	NC_015183	GCG	2	6	284277	284282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291727
6028	NC_015183	CCGC	2	8	284288	284295	0 %	0 %	25 %	75 %	325291727
6029	NC_015183	TCG	2	6	284350	284355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291727
6030	NC_015183	GA	3	6	284385	284390	50 %	0 %	50 %	0 %	325291727
6031	NC_015183	ATC	2	6	284400	284405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291727
6032	NC_015183	CCG	2	6	284426	284431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291727
6033	NC_015183	CTT	2	6	284455	284460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291727
6034	NC_015183	GCT	2	6	284468	284473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291727
6035	NC_015183	ACGA	2	8	284517	284524	50 %	0 %	25 %	25 %	325291727
6036	NC_015183	AG	3	6	284555	284560	50 %	0 %	50 %	0 %	325291727
6037	NC_015183	TCA	2	6	284634	284639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_015183	A	6	6	284710	284715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015183	ATC	2	6	284740	284745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291728
6040	NC_015183	GC	3	6	284747	284752	0 %	0 %	50 %	50 %	325291728
6041	NC_015183	TGC	2	6	284813	284818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291728
6042	NC_015183	CTT	2	6	284899	284904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291728
6043	NC_015183	CAA	2	6	284945	284950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291728
6044	NC_015183	GC	3	6	284959	284964	0 %	0 %	50 %	50 %	325291728
6045	NC_015183	GCTG	2	8	284973	284980	0 %	25 %	50 %	25 %	325291728
6046	NC_015183	CGG	3	9	284999	285007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291728
6047	NC_015183	TCA	2	6	285032	285037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291728
6048	NC_015183	CGG	2	6	285087	285092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291728
6049	NC_015183	CAT	2	6	285144	285149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291728
6050	NC_015183	CCG	2	6	285157	285162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291728
6051	NC_015183	CCA	2	6	285230	285235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291728
6052	NC_015183	GC	3	6	285242	285247	0 %	0 %	50 %	50 %	325291728
6053	NC_015183	CCG	3	9	285272	285280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291728
6054	NC_015183	CGC	2	6	285396	285401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291728
6055	NC_015183	TCG	2	6	285419	285424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291728
6056	NC_015183	CGCT	2	8	285427	285434	0 %	25 %	25 %	50 %	325291728
6057	NC_015183	TGG	2	6	285475	285480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291728
6058	NC_015183	GGC	2	6	285507	285512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291728
6059	NC_015183	CGTT	2	8	285550	285557	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_015183	ACC	2	6	285742	285747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291729
6061	NC_015183	A	6	6	285762	285767	100 %	0 %	0 %	0 %	325291729
6062	NC_015183	TAT	2	6	285791	285796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_015183	CGTT	2	8	285808	285815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_015183	CG	3	6	285816	285821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_015183	CGC	2	6	285827	285832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_015183	GT	3	6	285834	285839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_015183	CAAAAA	2	12	286075	286086	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6068	NC_015183	TGC	2	6	286140	286145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291730
6069	NC_015183	GCG	3	9	286319	286327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291730
6070	NC_015183	AGCGA	2	10	286342	286351	40 %	0 %	40 %	20 %	325291730
6071	NC_015183	CCG	3	9	286564	286572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291730
6072	NC_015183	GAA	2	6	286620	286625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291730
6073	NC_015183	GTC	2	6	286626	286631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291730
6074	NC_015183	GAT	2	6	286644	286649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291730
6075	NC_015183	TGC	2	6	286692	286697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291730
6076	NC_015183	GCC	2	6	287054	287059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291730
6077	NC_015183	CGA	2	6	287060	287065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291730
6078	NC_015183	CCG	2	6	287074	287079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291730
6079	NC_015183	CTC	2	6	287124	287129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_015183	GC	3	6	287176	287181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6081	NC_015183	GAC	2	6	287231	287236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_015183	CGA	2	6	287250	287255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291731
6083	NC_015183	TCA	2	6	287256	287261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291731
6084	NC_015183	GCC	3	9	287294	287302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291731
6085	NC_015183	ATCG	2	8	287326	287333	25 %	25 %	25 %	25 %	325291731
6086	NC_015183	TGC	2	6	287336	287341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291731
6087	NC_015183	GAT	2	6	287356	287361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291731
6088	NC_015183	TGCG	2	8	287367	287374	0 %	25 %	50 %	25 %	325291731
6089	NC_015183	CCG	2	6	287405	287410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291731
6090	NC_015183	CGTT	2	8	287477	287484	0 %	50 %	25 %	25 %	325291731
6091	NC_015183	CG	3	6	287501	287506	0 %	0 %	50 %	50 %	325291731
6092	NC_015183	TCC	2	6	287533	287538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6093	NC_015183	GC	3	6	287569	287574	0 %	0 %	50 %	50 %	325291732
6094	NC_015183	GTC	2	6	287580	287585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291732
6095	NC_015183	GCT	3	9	287599	287607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291732
6096	NC_015183	GGC	2	6	287633	287638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291732
6097	NC_015183	TCA	2	6	287684	287689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291732
6098	NC_015183	CCGG	2	8	287716	287723	0 %	0 %	50 %	50 %	325291732
6099	NC_015183	GAC	2	6	287739	287744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291732
6100	NC_015183	CCG	2	6	287774	287779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291732
6101	NC_015183	GCC	2	6	287805	287810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291732
6102	NC_015183	TGCC	2	8	287813	287820	0 %	25 %	25 %	50 %	325291732
6103	NC_015183	CG	3	6	287822	287827	0 %	0 %	50 %	50 %	325291732
6104	NC_015183	GCA	2	6	287843	287848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291732
6105	NC_015183	CAT	2	6	287894	287899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291732
6106	NC_015183	GCAG	2	8	287927	287934	25 %	0 %	50 %	25 %	325291732
6107	NC_015183	GCG	2	6	287962	287967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291732
6108	NC_015183	TGTCGA	2	12	288050	288061	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325291732
6109	NC_015183	ACC	2	6	288123	288128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291732
6110	NC_015183	AGAAC	2	10	288158	288167	60 %	0 %	20 %	20 %	325291732
6111	NC_015183	TTG	2	6	288201	288206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291732
6112	NC_015183	CGA	2	6	288227	288232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291732
6113	NC_015183	CG	4	8	288242	288249	0 %	0 %	50 %	50 %	325291732
6114	NC_015183	GCC	3	9	288349	288357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291733
6115	NC_015183	CGC	2	6	288423	288428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291733
6116	NC_015183	A	6	6	288556	288561	100 %	0 %	0 %	0 %	325291733
6117	NC_015183	CGG	2	6	288586	288591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291733
6118	NC_015183	GAT	2	6	288637	288642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291733
6119	NC_015183	GGC	2	6	288744	288749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291733
6120	NC_015183	CCGGAA	2	12	288795	288806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291733
6121	NC_015183	CCG	2	6	288807	288812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291733
6122	NC_015183	GATC	2	8	288813	288820	25 %	25 %	25 %	25 %	325291733
6123	NC_015183	GCAT	2	8	288848	288855	25 %	25 %	25 %	25 %	325291733
6124	NC_015183	GGA	2	6	288982	288987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291734
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6248	NC_015183	CAT	2	6	294374	294379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291739
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6250	NC_015183	TCT	2	6	294398	294403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291739
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6323	NC_015183	GAT	2	6	297578	297583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291743
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6351	NC_015183	CATG	2	8	299031	299038	25 %	25 %	25 %	25 %	325291744
6352	NC_015183	CGG	2	6	299040	299045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291744
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6354	NC_015183	GCC	2	6	299090	299095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291744
6355	NC_015183	TCACC	2	10	299177	299186	20 %	20 %	0 %	60 %	325291744
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6359	NC_015183	GCC	2	6	299415	299420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6360	NC_015183	TGT	2	6	299441	299446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6361	NC_015183	TGG	2	6	299470	299475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6362	NC_015183	A	7	7	299631	299637	100 %	0 %	0 %	0 %	325291745
6363	NC_015183	AAGG	2	8	299671	299678	50 %	0 %	50 %	0 %	325291745
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6369	NC_015183	GCCC	2	8	300098	300105	0 %	0 %	25 %	75 %	325291745
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6372	NC_015183	CGG	2	6	300216	300221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291745
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6392	NC_015183	GC	3	6	301064	301069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6393	NC_015183	AAGCCC	2	12	301101	301112	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325291746
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6475	NC_015183	CTGAT	2	10	305406	305415	20 %	40 %	20 %	20 %	325291750
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6481	NC_015183	CGAT	2	8	305739	305746	25 %	25 %	25 %	25 %	325291750
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6488	NC_015183	AGA	2	6	305997	306002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291750
6489	NC_015183	AGC	2	6	306009	306014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291750
6490	NC_015183	CCA	2	6	306076	306081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291750
6491	NC_015183	TGG	3	9	306099	306107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291750
6492	NC_015183	CGC	2	6	306112	306117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291750
6493	NC_015183	ATG	2	6	306189	306194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291750
6494	NC_015183	CGG	2	6	306198	306203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291750
6495	NC_015183	CAT	2	6	306211	306216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291750
6496	NC_015183	CAA	2	6	306229	306234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291750
6497	NC_015183	GGCCT	2	10	306265	306274	0 %	20 %	40 %	40 %	325291750
6498	NC_015183	GGC	2	6	306307	306312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291750
6499	NC_015183	TCG	2	6	306395	306400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291751
6500	NC_015183	GAC	2	6	306463	306468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291751

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